MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 45842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010803	TCC	2	6	196	201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345559
2	NC_010803	CGCT	2	8	283	290	0 %	25 %	25 %	50 %	189345559
3	NC_010803	T	7	7	366	372	0 %	100 %	0 %	0 %	189345559
4	NC_010803	ACT	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
5	NC_010803	TCA	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
6	NC_010803	CT	3	6	662	667	0 %	50 %	0 %	50 %	189345559
7	NC_010803	ATC	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
8	NC_010803	GAT	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345559
9	NC_010803	GGAAA	2	10	948	957	60 %	0 %	40 %	0 %	189345559
10	NC_010803	AGG	2	6	964	969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345559
11	NC_010803	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345559
12	NC_010803	TTCT	2	8	1018	1025	0 %	75 %	0 %	25 %	189345559
13	NC_010803	AGA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345559
14	NC_010803	CCG	2	6	1096	1101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345559
15	NC_010803	CAT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
16	NC_010803	CCA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189345559
17	NC_010803	ATC	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
18	NC_010803	CA	3	6	1329	1334	50 %	0 %	0 %	50 %	189345559
19	NC_010803	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345559
20	NC_010803	CTT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345559
21	NC_010803	ATC	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345559
22	NC_010803	TCAT	2	8	1534	1541	25 %	50 %	0 %	25 %	189345559
23	NC_010803	GAG	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345559
24	NC_010803	A	8	8	1589	1596	100 %	0 %	0 %	0 %	189345559
25	NC_010803	A	7	7	1608	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	189345559
26	NC_010803	CAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345560
27	NC_010803	GAG	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345560
28	NC_010803	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	189345560
29	NC_010803	A	6	6	2300	2305	100 %	0 %	0 %	0 %	189345560
30	NC_010803	TGCA	2	8	2370	2377	25 %	25 %	25 %	25 %	189345560
31	NC_010803	ATG	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345560
32	NC_010803	AGA	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345560
33	NC_010803	GAA	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345560
34	NC_010803	TTG	2	6	2519	2524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345560
35	NC_010803	TCGA	2	8	2584	2591	25 %	25 %	25 %	25 %	189345560
36	NC_010803	AG	3	6	2595	2600	50 %	0 %	50 %	0 %	189345560
37	NC_010803	TAA	2	6	2622	2627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345560
38	NC_010803	TTG	2	6	2651	2656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345560
39	NC_010803	AAT	2	6	2808	2813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345560
40	NC_010803	TGA	2	6	2931	2936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345560
41	NC_010803	CGG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345560
42	NC_010803	GAA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345560
43	NC_010803	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345560
44	NC_010803	GAGAG	2	10	3053	3062	40 %	0 %	60 %	0 %	189345560
45	NC_010803	ATT	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345561
46	NC_010803	CCT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345561
47	NC_010803	GGAA	2	8	3190	3197	50 %	0 %	50 %	0 %	189345561
48	NC_010803	T	7	7	3268	3274	0 %	100 %	0 %	0 %	189345561
49	NC_010803	TCA	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345561
50	NC_010803	AGA	2	6	3310	3315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345561
51	NC_010803	A	6	6	3350	3355	100 %	0 %	0 %	0 %	189345561
52	NC_010803	CTT	2	6	3381	3386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345561
53	NC_010803	TTC	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345561
54	NC_010803	CTT	2	6	3563	3568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345561
55	NC_010803	AG	4	8	3580	3587	50 %	0 %	50 %	0 %	189345561
56	NC_010803	TGC	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345561
57	NC_010803	TGA	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345561
58	NC_010803	TTC	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345561
59	NC_010803	GAA	2	6	3725	3730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345561
60	NC_010803	A	6	6	3824	3829	100 %	0 %	0 %	0 %	189345561
61	NC_010803	CA	3	6	3867	3872	50 %	0 %	0 %	50 %	189345561
62	NC_010803	T	6	6	3887	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	189345561
63	NC_010803	A	7	7	3910	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	189345561
64	NC_010803	CAG	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345561
65	NC_010803	CTGT	2	8	4005	4012	0 %	50 %	25 %	25 %	189345561
66	NC_010803	CTT	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345561
67	NC_010803	A	6	6	4110	4115	100 %	0 %	0 %	0 %	189345561
68	NC_010803	GAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345561
69	NC_010803	A	6	6	4162	4167	100 %	0 %	0 %	0 %	189345561
70	NC_010803	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345562
71	NC_010803	TGC	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345562
72	NC_010803	A	6	6	4359	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	189345562
73	NC_010803	GGA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345562
74	NC_010803	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	189345562
75	NC_010803	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	189345562
76	NC_010803	AAC	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345562
77	NC_010803	ATT	2	6	4453	4458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345562
78	NC_010803	T	6	6	4581	4586	0 %	100 %	0 %	0 %	189345563
79	NC_010803	T	7	7	4658	4664	0 %	100 %	0 %	0 %	189345563
80	NC_010803	ATC	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345563
81	NC_010803	GCA	3	9	4745	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345563
82	NC_010803	GCA	2	6	4784	4789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345563
83	NC_010803	TTG	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345563
84	NC_010803	ATT	2	6	4844	4849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345563
85	NC_010803	AT	3	6	4908	4913	50 %	50 %	0 %	0 %	189345563
86	NC_010803	GACT	2	8	4931	4938	25 %	25 %	25 %	25 %	189345563
87	NC_010803	T	6	6	5068	5073	0 %	100 %	0 %	0 %	189345563
88	NC_010803	T	6	6	5136	5141	0 %	100 %	0 %	0 %	189345563
89	NC_010803	TAG	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345563
90	NC_010803	CGT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345563
91	NC_010803	ATC	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345563
92	NC_010803	TTG	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345563
93	NC_010803	ACG	2	6	5459	5464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345563
94	NC_010803	GCA	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345563
95	NC_010803	TTTTA	2	10	5569	5578	20 %	80 %	0 %	0 %	189345563
96	NC_010803	TGT	2	6	5608	5613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345563
97	NC_010803	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345563
98	NC_010803	T	7	7	5625	5631	0 %	100 %	0 %	0 %	189345563
99	NC_010803	CGT	2	6	5659	5664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345563
100	NC_010803	CAT	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345563
101	NC_010803	TAT	2	6	5757	5762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345563
102	NC_010803	A	6	6	6007	6012	100 %	0 %	0 %	0 %	189345564
103	NC_010803	ATC	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
104	NC_010803	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345564
105	NC_010803	TG	3	6	6041	6046	0 %	50 %	50 %	0 %	189345564
106	NC_010803	CAG	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345564
107	NC_010803	GGAA	2	8	6141	6148	50 %	0 %	50 %	0 %	189345564
108	NC_010803	TCG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345564
109	NC_010803	TC	3	6	6209	6214	0 %	50 %	0 %	50 %	189345564
110	NC_010803	CT	3	6	6235	6240	0 %	50 %	0 %	50 %	189345564
111	NC_010803	ATA	2	6	6275	6280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189345564
112	NC_010803	CAT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
113	NC_010803	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189345564
114	NC_010803	AAG	2	6	6500	6505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345564
115	NC_010803	ATC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
116	NC_010803	T	8	8	6615	6622	0 %	100 %	0 %	0 %	189345564
117	NC_010803	T	7	7	6637	6643	0 %	100 %	0 %	0 %	189345564
118	NC_010803	CGA	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345564
119	NC_010803	CT	4	8	6709	6716	0 %	50 %	0 %	50 %	189345564
120	NC_010803	TCT	4	12	6714	6725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345564
121	NC_010803	TCCG	2	8	6758	6765	0 %	25 %	25 %	50 %	189345564
122	NC_010803	ATTCAA	2	12	6796	6807	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189345564
123	NC_010803	TGCAT	2	10	6936	6945	20 %	40 %	20 %	20 %	189345564
124	NC_010803	TCA	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
125	NC_010803	GCC	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345564
126	NC_010803	TGT	2	6	7182	7187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345564
127	NC_010803	CGAA	2	8	7233	7240	50 %	0 %	25 %	25 %	189345564
128	NC_010803	CAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
129	NC_010803	ACA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345564
130	NC_010803	A	7	7	7571	7577	100 %	0 %	0 %	0 %	189345564
131	NC_010803	CTT	2	6	7590	7595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345564
132	NC_010803	T	6	6	7794	7799	0 %	100 %	0 %	0 %	189345564
133	NC_010803	GAA	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345564
134	NC_010803	AG	3	6	7836	7841	50 %	0 %	50 %	0 %	189345564
135	NC_010803	ATG	2	6	7845	7850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345564
136	NC_010803	TTC	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345564
137	NC_010803	GTC	2	6	7928	7933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345564
138	NC_010803	CTG	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345564
139	NC_010803	A	6	6	8133	8138	100 %	0 %	0 %	0 %	189345564
140	NC_010803	T	7	7	8168	8174	0 %	100 %	0 %	0 %	189345564
141	NC_010803	TCA	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189345564
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143	NC_010803	AG	3	6	8213	8218	50 %	0 %	50 %	0 %	189345564
144	NC_010803	A	6	6	8219	8224	100 %	0 %	0 %	0 %	189345564
145	NC_010803	A	8	8	8273	8280	100 %	0 %	0 %	0 %	189345564
146	NC_010803	CAA	2	6	8314	8319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189345564
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148	NC_010803	ATGA	2	8	8594	8601	50 %	25 %	25 %	0 %	189345565
149	NC_010803	GAT	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345565
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151	NC_010803	ATCT	2	8	8679	8686	25 %	50 %	0 %	25 %	189345565
152	NC_010803	TGT	2	6	8712	8717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345565
153	NC_010803	AAG	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345565
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155	NC_010803	GAA	2	6	8977	8982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345565
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159	NC_010803	GAG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345565
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163	NC_010803	AAGA	2	8	9435	9442	75 %	0 %	25 %	0 %	189345565
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172	NC_010803	AGA	2	6	9967	9972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345565
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265	NC_010803	TGC	2	6	16459	16464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345572
266	NC_010803	TTC	2	6	16506	16511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189345572
267	NC_010803	TGA	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345572
268	NC_010803	CAAAG	2	10	16630	16639	60 %	0 %	20 %	20 %	189345572
269	NC_010803	GAC	2	6	16658	16663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345572
270	NC_010803	GCT	2	6	16664	16669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345572
271	NC_010803	AG	3	6	16724	16729	50 %	0 %	50 %	0 %	189345572
272	NC_010803	AG	3	6	16772	16777	50 %	0 %	50 %	0 %	189345572
273	NC_010803	CAG	2	6	16799	16804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189345572
274	NC_010803	AGAA	2	8	16823	16830	75 %	0 %	25 %	0 %	189345572
275	NC_010803	GCG	2	6	17013	17018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189345572
276	NC_010803	A	7	7	17038	17044	100 %	0 %	0 %	0 %	189345572
277	NC_010803	TCAGC	2	10	17063	17072	20 %	20 %	20 %	40 %	189345572
278	NC_010803	GGA	2	6	17075	17080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345572
279	NC_010803	GAAG	2	8	17143	17150	50 %	0 %	50 %	0 %	189345572
280	NC_010803	CGT	2	6	17164	17169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345572
281	NC_010803	AGG	2	6	17211	17216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345572
282	NC_010803	TGC	2	6	17272	17277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345572
283	NC_010803	TTCG	2	8	17295	17302	0 %	50 %	25 %	25 %	189345572
284	NC_010803	TGGG	2	8	17385	17392	0 %	25 %	75 %	0 %	189345572
285	NC_010803	GAA	2	6	17413	17418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345572
286	NC_010803	AG	3	6	17453	17458	50 %	0 %	50 %	0 %	189345572
287	NC_010803	TCC	2	6	17512	17517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345572
288	NC_010803	TGAA	2	8	17550	17557	50 %	25 %	25 %	0 %	189345572
289	NC_010803	A	6	6	17556	17561	100 %	0 %	0 %	0 %	189345572
290	NC_010803	GAG	2	6	17606	17611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189345572
291	NC_010803	T	7	7	17721	17727	0 %	100 %	0 %	0 %	189345573
292	NC_010803	TCGT	2	8	17954	17961	0 %	50 %	25 %	25 %	189345573
293	NC_010803	CTG	2	6	17978	17983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345573
294	NC_010803	GA	3	6	18047	18052	50 %	0 %	50 %	0 %	189345573
295	NC_010803	GAA	2	6	18065	18070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189345573
296	NC_010803	CATCGG	2	12	18109	18120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189345573
297	NC_010803	ATG	3	9	18123	18131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189345573
298	NC_010803	GA	3	6	18157	18162	50 %	0 %	50 %	0 %	189345573
299	NC_010803	CTC	3	9	18164	18172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345573
300	NC_010803	TCCCT	2	10	18300	18309	0 %	40 %	0 %	60 %	189345573
301	NC_010803	CCT	2	6	18321	18326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189345573
302	NC_010803	GCC	2	6	18456	18461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345573
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307	NC_010803	GCC	2	6	18773	18778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345573
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309	NC_010803	TGG	2	6	18859	18864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189345573
310	NC_010803	TA	4	8	18879	18886	50 %	50 %	0 %	0 %	189345573
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312	NC_010803	CGC	2	6	19159	19164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189345573
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318	NC_010803	TCG	2	6	19455	19460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189345573
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322	NC_010803	CATCG	2	10	19780	19789	20 %	20 %	20 %	40 %	189345574
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391	NC_010803	A	8	8	23100	23107	100 %	0 %	0 %	0 %	189345577
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393	NC_010803	TGT	2	6	23329	23334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189345577
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